本书共分五篇，分别从微生物学基础、微生物生态学、环境微生物监测、环境污染微生物控制以及资源环境微生物五大方面介绍了微生物的类群和结构，微生物在自然界中的分布以及它们的营养、代谢、遗传和变异；微生物与环境的相互作用，微生物在自然界物质循环中的作用；环境微生物监测原理和技术；微生物在自然环境自净、污染环境修复中的作用及原理；资源微生物及环境友好微生物制剂等。

本书在总体内容上重视基础知识、基本理论、基本规律的阐述，精选具体的内容与实例，反映了学科现代成就与发展趋势，力求结合我国国情，反映我国的环保特色，同时兼具实用性。本书内容充实，图文并茂，具有较高的学术和实用价值，可作为环境科学、环境工程、生物工程专业高年级本科生教材，也可作为相关专业研究生教学参考书及科研人员、工程技术人员的参考用书。